问题描述
我需要帮助才能知道我的块和网格的大小。 我正在构建一个python应用程序来执行基于Scipy的公制计算:欧几里德距离、曼哈顿、皮尔逊、余弦、加入其他。
项目为PycudaDistances。
它似乎可以很好地处理小数组。当我执行更详尽的测试时,不幸的是它不起作用。我下载了电影镜头集(http://www.grouplens.org/node/73)。
使用Movielens
100k,我声明了一个形状为(943,1682)的数组。也就是说,用户对943部和1682部电影进行了评价。电影不是由分类器用户我将值配置为0。
使用更大的数组算法不再起作用。我面临以下错误:
pycuda._driver.LogicError:cuFuncSetBlockShape失败:无效值。
研究此错误时,我找到了一个解释,告诉支持512个线程的Andrew加入并处理较大的块时,必须使用块和网格。
我希望得到帮助,使欧几里德距离数组算法能够从小数组工作到巨型数组。
def euclidean_distances(X, Y=None, inverse=True):
X, Y = check_pairwise_arrays(X,Y)
rows = X.shape[0]
cols = Y.shape[0]
solution = numpy.zeros((rows, cols))
solution = solution.astype(numpy.float32)
kernel_code_template = """
#include <math.h>
__global__ void euclidean(float *x, float *y, float *solution) {
int idx = threadIdx.x + blockDim.x * blockIdx.x;
int idy = threadIdx.y + blockDim.y * blockIdx.y;
float result = 0.0;
for(int iter = 0; iter < %(NDIM)s; iter++) {
float x_e = x[%(NDIM)s * idy + iter];
float y_e = y[%(NDIM)s * idx + iter];
result += pow((x_e - y_e), 2);
}
int pos = idx + %(NCOLS)s * idy;
solution[pos] = sqrt(result);
}
"""
kernel_code = kernel_code_template % {
'NCOLS': cols,
'NDIM': X.shape[1]
}
mod = SourceModule(kernel_code)
func = mod.get_function("euclidean")
func(drv.In(X), drv.In(Y), drv.Out(solution), block=(cols, rows, 1))
return numpy.divide(1.0, (1.0 + solution)) if inverse else solution
有关详细信息,请参阅:https://github.com/vinigracindo/pycudaDistances/blob/master/distances.py
推荐答案
要调整内核执行参数的大小,您需要执行两项操作(按此顺序):
1.确定挡路大小
您的挡路大小主要取决于硬件限制和性能。我推荐阅读this answer以获取更多详细信息,但非常简短的总结是,您的图形处理器对每个挡路可以运行的线程总数有限制,并且它有有限的寄存器堆、共享和本地内存大小。您选择的挡路维度必须在这些限制之内,否则内核将无法运行。挡路的大小也会影响内核的性能,你会发现挡路的大小可以提供最佳的性能。挡路大小应始终是翘曲大小的整数倍,在迄今发布的所有CUDA兼容硬件上,后者为32。
2.确定网格大小
对于您所显示的内核类型,您需要的块数与输入数据量和每个挡路的维度直接相关。
例如,如果您的输入数组大小为943x1682,而您的挡路大小为16x16,那么您将需要一个59x106网格,这将在内核启动时产生944x1696个线程。在这种情况下,输入数据大小不是挡路大小的整数倍,您需要修改内核以确保它不会读取越界。一种方法可能类似于:__global__ void euclidean(float *x, float *y, float *solution) {
int idx = threadIdx.x + blockDim.x * blockIdx.x;
int idy = threadIdx.y + blockDim.y * blockIdx.y;
if ( ( idx < %(NCOLS)s ) && ( idy < %(NDIM)s ) ) {
.....
}
}
启动内核的python代码可能类似于:
bdim = (16, 16, 1)
dx, mx = divmod(cols, bdim[0])
dy, my = divmod(rows, bdim[1])
gdim = ( (dx + (mx>0)) * bdim[0], (dy + (my>0)) * bdim[1]) )
func(drv.In(X), drv.In(Y), drv.Out(solution), block=bdim, grid=gdim)
This question and answer还可能有助于了解此过程的工作原理。
请注意,上述所有代码都是在浏览器中编写的,从未经过测试。使用它的风险自负。还请注意,它基于对您的代码的非常简短的阅读,可能不正确,因为您在问题中没有真正描述任何有关如何调用代码的内容。
这篇关于Pycuda块和格网,用于处理大数据的文章就介绍到这了,希望我们推荐的答案对大家有所帮助,也希望大家多多支持跟版网!